Panoramica

Le vescicole extracellulari (EV) sono particelle eterogenee composte da lipidi e massivamente secrete dalle cellule. Le EV sono costituite da diversi tipi di lipidi e cariche di RNA, proteine ​​e metaboliti che possono essere scambiati da cellule vicine o distanti attraverso i fluidi corporei. Le vescicole circolanti possono essere sfruttate in biopsia liquida o manipolate per progettare nuovi veicoli che consentano il trasferimento orizzontale di materiale biologico.

Indirizzi di ricerca

Noi studiamo le EV includendo tre diversi aspetti:

  • Sviluppare nuovi metodi per la medicina di precisione: abbiamo cercato di applicare procedure ad alto rendimento per EV da terreni di coltura cellulare o fluidi biologici (sangue, urina, liquor, saliva) e approcci quantitativi per rilevare biomarcatori di eterogeneità associati a malattie oncologiche;
  • Applicare approcci quantitativi per comprendere l’effetto funzionale del trasferimento di materiale biologico a cellule riceventi, focalizzandoci su RNA e proteine e al meccanismo di selezione per il trasporto in EV;
  • Generare nuovi veicoli biologici: Le vescicole espongono diverse proteine transmembrana che possono essere potenzialmente sfruttati per alterare e comprendere la loro biodistribuzione. Diversi approcci possono essere utilizzati per generare sottopopolazioni di vescicole caratterizzate da una definita biodistribuzione e potenziale effetto anti-tumorale.

Membri del gruppo

  • Vito Giuseppe D’Agostino, Professore Associato (PI)
  • Michela Notarangelo, Postdoc
  • Elena Gurrieri, Studentessa di dottorato
  • Fabrizio Fabbiano, Studente di dottorato
  • Jessica Corsi, Studentessa di dottorato
  • LM and LT Studenti

Collaborazioni

  • Elena Elez, VHIO, Spagna
  • Stefan Lehr, DDZ, Germania
  • Tero Aittokallio, FIMM, Finlandia
  • Robin Ristl, MUW, Austria

Pubblicazioni selezionate

Pasetto L, Callegaro S, Corbelli A, Fiordaliso F, Ferrara D, Brunelli L, Sestito G, Pastorelli R, Bianchi E, Cretich M, Chiari M, Potrich C, Moglia C, Corbo M, Sorarù G, Lunetta C, Calvo A, Chiò A, Mora G, Pennuto M, Quattrone A, Rinaldi F, D'Agostino VG, Basso M, Bonetto V. Decoding distinctive features of plasma extracellular vesicles in amyotrophic lateral sclerosis. Mol Neurodegener. 2021 Aug 10;16(1):52. doi: 10.1186/s13024-021-00470-3. PMID: 34376243; PMCID: PMC8353748.

Pasini L, Notarangelo M, Vagheggini A, Burgio MA, Crinò L, Chiadini E, Prochowski AI, Delmonte A, Ulivi P, D'Agostino VG. Unveiling mutational dynamics in non-small cell lung cancer patients by quantitative EGFR profiling in vesicular RNA. Mol Oncol. 2021 Sep;15(9):2423-2438. doi: 10.1002/1878-0261.12976. Epub 2021 May 20. PMID: 33942501; PMCID: PMC8410558.

Mangiapane G, Parolini I, Conte K, Malfatti MC, Corsi J, Sanchez M, Pietrantoni A, D'Agostino VG, Tell G. Enzymatically active apurinic/apyrimidinic endodeoxyribonuclease 1 is released by mammalian cells through exosomes. J Biol Chem. 2021 Jan-Jun;296:100569. doi: 10.1016/j.jbc.2021.100569. Epub 2021 Mar 19. PMID: 33753167; PMCID: PMC8080531.

Notarangelo M, Ferrara D, Potrich C, Lunelli L, Vanzetti L, Provenzani A, Basso M, Quattrone A, D'Agostino VG. Rapid Nickel-based Isolation of Extracellular Vesicles from Different Biological Fluids. Bio Protoc. 2020 Feb 5;10(3):e3512. doi: 10.21769/BioProtoc.3512. PMID: 33654737; PMCID: PMC7842538.

Fabbiano F, Corsi J, Gurrieri E, Trevisan C, Notarangelo M, D'Agostino VG. RNA packaging into extracellular vesicles: An orchestra of RNA-binding proteins? J Extracell Vesicles. 2020 Dec;10(2):e12043. doi: 10.1002/jev2.12043. Epub 2020 Dec 28. PMID: 33391635; PMCID: PMC7769857.

Notarangelo M, Zucal C, Modelska A, Pesce I, Scarduelli G, Potrich C, Lunelli L, Pederzolli C, Pavan P, la Marca G, Pasini L, Ulivi P, Beltran H, Demichelis F, Provenzani A, Quattrone A, D'Agostino VG. Ultrasensitive detection of cancer biomarkers by nickel-based isolation of polydisperse extracellular vesicles from blood. EBioMedicine. 2019 May;43:114-126. doi: 10.1016/j.ebiom.2019.04.039. Epub 2019 Apr 29. PMID: 31047861; PMCID: PMC6558028.

D'Agostino VG, Sighel D, Zucal C, Bonomo I, Micaelli M, Lolli G, Provenzani A, Quattrone A, Adami V. Screening Approaches for Targeting Ribonucleoprotein Complexes: A New Dimension for Drug Discovery. SLAS Discov. 2019 Mar;24(3):314-331. doi: 10.1177/2472555218818065. Epub 2019 Jan 7. PMID: 30616427.

Dalle Vedove A, Spiliotopoulos D, D'Agostino VG, Marchand JR, Unzue A, Nevado C, Lolli G, Caflisch A. Structural Analysis of Small-Molecule Binding to the BAZ2A and BAZ2B Bromodomains. ChemMedChem. 2018 Jul 18;13(14):1479-1487. doi: 10.1002/cmdc.201800234. Epub 2018 Jun 21. PMID: 29770599.

Lal P, Cerofolini L, D'Agostino VG, Zucal C, Fuccio C, Bonomo I, Dassi E, Giuntini S, Di Maio D, Vishwakarma V, Preet R, Williams SN, Fairlamb MS, Munk R, Lehrmann E, Abdelmohsen K, Elezgarai SR, Luchinat C, Novellino E, Quattrone A, Biasini E, Manzoni L, Gorospe M, Dixon DA, Seneci P, Marinelli L, Fragai M, Provenzani A. Regulation of HuR structure and function by dihydrotanshinone-I. Nucleic Acids Res. 2017 Sep 19;45(16):9514-9527. doi: 10.1093/nar/gkx623. PMID: 28934484; PMCID: PMC5766160.

D'Agostino VG, Lal P, Mantelli B, Tiedje C, Zucal C, Thongon N, Gaestel M, Latorre E, Marinelli L, Seneci P, Amadio M, Provenzani A. Dihydrotanshinone-I interferes with the RNA-binding activity of HuR affecting its posttranscriptional function. Sci Rep. 2015 Nov 10;5:16478. doi: 10.1038/srep16478. PMID: 26553968; PMCID: PMC4639722.