Genetica e fisiologia batterica

Lo scopo principale della nostra ricerca è quello di elucidare gli aspetti importanti sulla modalità con cui i batteri Gram-positivi di forma sferico-ovoidale coordinano i processi di allungamento e divisione, concentrando la nostra attenzione sulle proteine essenziali coinvolte e sui loro partner di interazione, al fine di determinarne la loro struttura e la funzione.

Per ottenere mantenere la loro forma durante il ciclo cellulare, i batteri sfruttano le proteine del loro citoscheletro le quali, tramite polimerizzazione, traducono le interazioni molecolari in una dimensione su più larga scala nella cellula. La maggior parte delle conoscenze che abbiamo riguardo il ciclo cellulare batterico deriva dai più studiati modelli di forma bastoncellare, come Escherichia coli e Bacillus subtilis, i quali crescono principalmente tramite allungamento laterale e successiva divisione, una per ogni generazione, tramite la sintesi di un setto di perpendicolare. In questi modelli di forma bastoncellare, l’allungamento laterale è organizzato dalla proteina MreB, un omologo dell’actina che assembla il complesso biosintetico, noto come elongasoma, responsabile della sintesi laterale della parete cellulare. La divisione cellulare è invece organizzata da FtsZ, un omologo della tubulina che insieme a FtsA, omologo della actina, assembla il complesso biosintetico noto come divisoma responsabile della sintesi della parete cellulare a livello del setto. In modo simile a quanto accade nei bastoncelli, anche S. pneumoniae cresce alternando la sintesi di parete cellulare laterale e a livello del setto, anche se la seconda prevale sulla prima, per ottenere come risultato la caratteristica forma ovale caratteristica di questi batteri, che per questo motivo sono chiamati ovococchi. A sostegno di questo modello, il genoma di S. pneumoniae contieni i geni che codificano le componenti che costituiscono l’elongasoma e il divisoma presenti nei batteri di forma bastoncellare ma, come gli altri cocchi, non possiedono il gene che codifica MreB. Inoltre, anziché avere due complessi biosintetici separati, pneumococco assembla al centro della cellula sia le componenti dell'elongasoma sia quelle del divisoma in un unico complesso, il quale svolge entrambe le funzioni. Questo complesso necessita di un controllo preciso, operato dalla Ser/Thr chinasi di tipo eucariotico, StkP, che integra l’allungamento laterale con la divisione cellulare, con un meccanismo i cui dettagli rimangono ad oggi ancora da chiarire. 

La maggior parte del lavoro che stiamo attualmente svolgendo è concentrato sullo studio delle interazioni tra le diverse proteine che compongono gli apparati di crescita e di divisione cellulare di S. pneumoniae, la loro complessa rete di interazioni e le dinamiche alla base della loro localizzazione cellulare. Il nostro scopo è quello di identificare quali siano gli elementi e i motivi chiave presenti in queste proteine, ed eventualmente nella cellula, indispensabili per la vita del batterio.

Questo ci darà anche la possibilità di identificare e validare nuovi bersagli, che potranno essere sfruttati per lo sviluppo di nuovi antibiotici, la cui scoperta è alquanto urgente per contrastare il problema della resistenza.