Single Cell Analysis
La Core Facility Single Cell Analysis mette a disposizione strumentazione e competenze per affrontare quesiti biologici a risoluzione a singola cellula. Il team multidisciplinare integra le competenze complementari delle core facility Cell Analysis and Separation (CAS), High Throughput Screening (HTS) e Next Generation Sequencing (NGS), collegando la preparazione del campione e l’isolamento cellulare con la profilazione e il sequenziamento a singola cellula.
Il team collabora a stretto contatto con i gruppi di ricerca per individuare la tecnologia più adatta e progettare flussi di lavoro personalizzati in base al tessuto, alle caratteristiche del campione e agli obiettivi scientifici. Oltre alle applicazioni consolidate, la facilty supporta lo sviluppo, l’ottimizzazione e l’implementazione di nuovi protocolli, adattando gli approcci a campioni complessi e a nuove esigenze sperimentali.
Il successo di un esperimento a singola cellula dipende in larga misura dalla qualità della preparazione del campione. Prima di avviare un progetto, si raccomanda di discuterne con il personale della facility, per definire un’adeguata strategia di isolamento di cellule o di nuclei. Su richiesta, il personale supporta la valutazione delle opzioni disponibili, l’individuazione delle fasi critiche e la pianificazione sperimentale.
- Droplet-based: 10x Genomics Chromium
- Microwell-based: BD Rhapsody HT Xpress and Takara iCELL8 cx
- Combinatorial Indexing: Parse Biosciences
Alessandro Mattè
Chiara Valentini
Veronica de Sanctis
Viktoryia Sidarovich"