Call n. 76/2013: n. 1 contract of intellectual work service

Responsible for the Activity/Task Alessandro Quattrone
Subject of the Contract Supporto informatico e bioinformatico per le attività del Laboratory of Biomolecular Sequence and Structure Analysis for Health (LaBSSAH) e delle attività di ricerca del CIBIO.

Il/la candidato/a dovrà: 
- Collaborare alla realizzazione e gestione della rete del LaBSSAH; 
- Gestire il flusso dati del LaBSSAH e l’accesso differenziato a singoli e/o gruppo di ricercatori sulla base di progetti specifici; 
- Implementare e mantenere le pipeline per il pre-processamento dei dati generati dai sequenziatori del LaBSSAH ed effettuare controlli di qualità dei dati; 
- Affiancare i ricercatori nel disegno sperimentale in collaborazione con i manager del LaBSSAH;
- Fornire supporto bioinformatico per lo svolgimento di progetti di ricerca che utilizzano piattaforme di sequenziamento e/o di array e/o che richiedono l’utilizzo di strumenti di analisi quantitativa o di riconoscimento di sequenze per l’identificazione di motivi. 
Publication Date 20 May 2013
Deadline 17 June 2013 at Midday
Contacts alessandro.quattrone [at] unitn.it
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Call n. 75/2013: n. 1 contract of intellectual work service

Responsible for the Activity/Task Alessandro Quattrone
Subject of the Contract Il candidato dovrà fornire supporto tecnico alle attività sperimentali della facility di High Throughput Screening (HTS) del CIBIO nell’ambito del progetto AGER (Melo) finalizzato allo studio degli effetti di molecole bioattive in vitro ed in vivo. Nello specifico, il candidato dovrà eseguire saggi in vitro per lo screening di piccole molecole o di siRNA, estrazione e purificazione di acidi nucleici, analisi quantitativa di acidi nucleici, ibridazioni di microarray.
Publication Date 13 May 2013
Deadline 30 May 2013 at Midday
Contacts alessandro.quattrone [at] unitn.it
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Call n. 74/2013: n. 1 contract of intellectual work service

Responsible for the Activity/Task Alessandro Quattrone
Subject of the Contract La prestazione riguarda principalmente l’attività di supporto scientifico ai progetti di High Throughput Screening (HTS) con ricercatori del CIBIO e collaboratori esterni, che verrà svolta nella HTS core facility del centro stesso. Nello specifico, il candidato dovrà occuparsi di sviluppare nuovi saggi biochimici e cellulari per lo screening di piccole molecole o di siRNA.
Publication Date 13 May 2013
Deadline 30 May 2013 at Midday
Contacts alessandro.quattrone [at] unitn.it
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Call n. 73/2013: n. 1 research fellowship

Principal Investigator Massimo Pizzato
Research Title Defining molecular determinants of retroviral latency.
Research Aims The ability of lentiviruses to establish a latent infection is the main barrier to the eradication of HIV. Starting from our observation that propensity to establish latency varies greatly among different primate lentiviruses, the objective of the research is to identify the features which determine such variation in order to establish the fine molecular mechanisms regulating latency. An additional objective is the development of a novel cellular model to perform screening for the identification of compounds capable of reactivating latent retroviruses.
Publication Date 13 May 2013
Deadline 30 May 2013 at Midday
Contacts massimo.pizzato [at] unitn.it
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Call n. 72/2013: n. 1 contract of intellectual work service

Responsible for the Activity/Task Francesca Demichelis
Subject of the Contract Alterazioni genomiche nei tumori prostatici come marcatori di risposta alla brachiterapia. La ricerca è volta alla caratterizzazione di lesioni genomiche in tumori prostatici di pazienti trattati con brachiterapia. La ricerca include l’utilizzo di metodiche di conservazione e di trattamento di tessuti freschi e di archivio e di tecniche biomelocolari
Publication Date 9 May 2013
Deadline 29 May 2013 at Midday
Contacts f.demichelis [at] unitn.it
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Call n. 70/2013: n. 1 research fellowship

Principal Investigator Olivier Jousson
Research Title

Functional, structural and applicative studies on OMVs from gram-negative bacteria 
Research Aims

1)Analysis of proteic composition of OMVs from Wild-type and mutant straints; 
2)Analysis of production and regulation mechanisms of OMVs production; 3)Expression of heterologous proteins on the lumen and membrane of OMVs.
Publication Date 09 May 2013
Deadline 28 May 2013 at Midday
Contacts olivier.jousson_5 [at] unitn.it
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Call n. 68/2013: n. 1 research fellowship

Principal Investigator Sheref S. Mansy
Research Title Development of encapsulated aqueous multi- phase systems
Research Aims To develop aqueous multiphase systems compatible with transcription-translation machinery 
Publication Date 08 May 2013
Deadline 28 May 2013 at Midday
Contacts sherefsamir.mansy [at] unitn.it

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Call n. 64/2013: n. 1 research fellowship

Principal Investigator Francesca Demichelis
Research Title

Tumor evolution study
Research Aims

Tumor evolution characterization through the quantitative assessment of the clonality status of somatic lesions utilizing Next Generation Sequencing data
Publication Date 07 May 2013
Deadline 23 May 2013 at Midday
Contacts f.demichelis [at] unitn.it
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Call n. 54/2013: n. 1 research fellowship

Principal Investigator Paolo Macchi
Research Title Investigating the roles of the RNA-binding proteins Pumilio 1 and 2 in central nervous system
Research Aims Investigating the role of Pum1 and Pum2:

- in neuronal stem cell maintenance; axon guidance; cell differentiation using in vitro and in vivo approaches.
- Expression analysis of Pum1 and Pum2 proteins in neuronal growth cones.
- Loss of function approach for Pum1 and Pum2 in vitro and in vivo.
- Identification of potential miRNAs regulating Pum1 and Pum2 translation in the central nervous system.
Publication Date 09 April 2013
Deadline 14 May 2013 at 1:00 p.m.
Contacts macchi [at] science.unitn.it
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Call n. 47/2013: n. 1 research fellowship

Principal Investigator Alessandro Quattrone
Research Title Analysis of the role of translational control in
asymmetric cell division in glioma cells
Research Aims

The activity is aimed at identifying genes involved in translational control responsible of asymmetric cell division alterations in glioma cells
Publication Date 22 March 2013
Deadline 11 April 2013 at Midday
Contacts alessandro.quattrone [at] unitn.it
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Call n. 46/2013: n. 1 research fellowship

Principal Investigator Alberto Inga
Research Title P53-directed post-transcriptional/translational control of gene expression: decoding the p53 translatome.
Research Aims We propose that besides transcriptional selectivity, the p53 response network is strongly regulated by translational selectivity through multiple mechanisms, of which one is represented by the growing list of p53-targeted microRNA genes. The overall impact of p53, or of p53 activating stimuli, on RNA maturation, mRNA stability and translation potential remains largely unexplored and is the primary subject of this proposal. Specifically, we will pursue three closely related tasks, taking advantage of recent results, core facilities at the host institution and the contribution of local and external collaborators. One aim will be focused on the analysis of the VEGFR1, FLT1 gene, that we recently established as a direct p53 and Estrogen Receptor target. We have now observed that p53-inducing stresses markedly differ for the impact on the relative levels of two major splice variants of the gene’s primary transcript that result in a membrane bound (mFLT1) and a secreted form (sFLT1) of the receptor. The mechanisms for this effect and the direct role of p53 on the relative stability of those two FLT1 mRNAs as well as on the regulation of alternative splicing will be investigated.The uncoupling between transcription and translation potential on a global scale will be studied as a second task by polysomal profiling coupled to expression microarray, an approach that would enable us to compare transcriptome (i.e. changes at the level of total mRNA) and translatome (i.e. changes at the level of polysome-associated mRNAs). The effect of p53- inducing genotoxic drugs (doxorubicin, 5FU) or p53-activating molecules (Nutlin, RITA) will be studied. Cis-element enrichment and co- occurrences within promoter regions, 5’UTR and 3’UTR of genes exhibiting transcription / translation coupling or uncoupling will be sought out for cues of underlying mechanisms. More specifically, focused experiments will be developed to test the impact of RNA binding proteins (HuR, hnRNP-K, RBM24, RNP-C1), selected based upon preliminary data on mRNA fate. As a third aim, RNA-seq will be used to explore the impact of p53 modulation primarily on alternative splicing events on a global scale.
Publication Date 21 March 2013
Deadline 10 April 2013 at Midday
Contacts alberto.inga [at] unitn.it
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Call n. 42/2013: n. 1 contract of intellectual work service

Responsible for the Activity/Task Simona Casarosa
Subject of the Contract

- Cura e mantenimento dei sistemi di stabulazione del CIBIO e degli animali (sia line wild type che mutanti).
- Organizzazione di un servizio di produzione di embrioni di Anfibi e Pesci a differenti stadi di sviluppo, da utilizzare per esperimenti di istologia e biologia molecolare.
- Collaborazione con il personale già presente, i ricercatori e con gli studenti per la messa a punto e per lo svolgimento delle procedure sperimentali.
- Mantenimento e ordine del materiale e dei reagenti necessari per la stabulazione e per l’attività da svolgere dentro la facility.
- Assistenza nelle produzione di protocolli operativi.
Publication Date 19 March 2013
Deadline 08 April 2013 at Midday
Contacts simona.casarosa [at] unitn.it
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Call n. 39/2013: n. 1 contract of intellectual work service

Responsible for the Activity/Task Alessandro Quattrone
Subject of the Contract - Corso su temi inerenti alla vaccinologia strutturale e molecolare presso il dottorato internazionale di Biomolecular Sciences dell’Università degli Studi di Trento;

- Attività di training e approfondimento culturale di studenti del corso di Laurea in Scienze e Tecnologie Biomolecolari, del dottorato di ricerca e di PostDoc. Tale attività verrà svolta mediante la supervisione scientifica di progetti di ricerca sperimentale presso il CIBIO.
Publication Date 11 March 2013
Deadline 28 March 2013 at Midday
Contacts alessandro.quattrone [at] unitn.it
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Call n. 38/2013: n. 1 contract of intellectual work service

Responsible for the Activity/Task Olivier Jousson 
Subject of the Contract Implementazione e ulteriore sviluppo di una piattaforma software per la caratterizzazione tassonomica di comunità batteriche da dati di tipo metagenomico.
Publication Date 11 March 2013
Deadline 28 March 2013 at Midday
Contacts jousson [at] science.unitn.it
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Call n. 33/2013: n. 1 research fellowship

Principal Investigator Olivier Jousson
Research Title Studi funzionali, strutturali ed applicativi di OMV da batteri Gram-negativi
Research Aims a) Analysis of proteic composition of OMVs from wild-type and mutant straints;
b) Analysis of production and regulation mechanisms of OMVs production;
c) Expression of heterologous proteins on the lumen and membrane of OMVs.
Publication Date 04 March 2013
Deadline 25 March 2013 at Midday
Contacts jousson [at] science.unitn.it
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Call n. 32/2013: n. 1 research fellowship

Principal Investigator Francesca Demichelis
Research Title Defining Heritable Cancer Risk Variants in the Prostate
Research Aims To assess the tissue specific oncogenic effect of prostate cancer risk variants. To evaluate the synergistic effect of prostate cancer risk variants and prostate cancer somatic aberrations towards tumor progression.
Publication Date 04 March 2013
Deadline 25 March 2013 at Midday
Contacts f.demichelis [at] unitn.it
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Call n. 21/2013: n. 1 contract of intellectual work service

Responsible for the Activity/Task Alessandro Quattrone
Subject of the Contract

Supporto per la emanazione di progetti di spin-off, per la costruzione di una rete di relazioni con aziende biotecnologiche e farmaceutiche, per l’attività di placement di personale operante presso il CIBIO.

Il/la candidato/a dovrà:

- realizzare attività di identificazione delle potenziali applicazioni tecnologiche nei progetti di ricerca che vengono svolti presso il CIBIO, e curare ove ritenuto opportuno gli aspetti scientifici del relativo percorso brevettuale;

- favorire la collaborazione fra ricercatori del CIBIO e ricercatori operanti presso altre istituzioni del sistema trentino della ricerca;
- promuovere l’offerta di servizi tecnologici realizzati presso le facilities operanti al CIBIO verso fruitori esterni, e curare gli aspetti scientifici del relativo percorso contrattuale;
- contribuire all’organizzazione di eventi volti a favorire l’interazione fra laureati, dottori di ricerca e assegnisti di ricerca operanti presso il CIBIO con aziende e centri di ricerca europei;
- promuovere la visibilità del CIBIO in contesti di ricerca aziendale italiana ed europea, favorendo la formazione di reti di collaborazione università-industria e l’applicazione a bandi di finanziamento;
- curare gli aspetti scientifici dell’immagine del CIBIO presso altre istituzioni di ricerca europee ed extraeuropee.
Publication Date 7 February 2013
Deadline 27 February 2013 at Midday
Contacts alessandro.quattrone [at] unitn.it
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Call n. 20/2013: n. 1 study grant for doctoral students who have not been awarded with a doctoral grant enrolled to the International Doctoral School in Biomolecular Sciences

Principal Investigator Massimo Pizzato
Research Title The role of mTOR in HIV replication
Research Aims Starting from the recently obtained evidence that the lentiviral protein Nef interacts with the cellular kinase mTOR, the research will investigate the functional relevance of such interaction, the regulation of mTOR activity by Nef and the role of mTOR during HIV replication in the natural target cells.
Publication Date 7 February 2013
Deadline 27 February 2013 at Midday
Contacts massimo.pizzato [at] unitn.it
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Call n. 18/2013: n. 1 research fellowship

Principal Investigator Olivier Jousson
Research Title Bioinformatic and machine learning for microbial genomics and meta’omics studies
Research Aims Development of computational in the development of computational and
software systems to aid the analysis of taxonomic, functional, and phylogenetic characteristics of single organisms and of complex microbial communities using high-throughput sequencing data from reference genomes as well as metagenomic and metatranscriptomic datasets.
Publication Date 7 February 2013
Deadline 27 February 2013 at Midday
Contacts jousson [at] science.unitn.it
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Call n. 16/2013: n. 1 research fellowship

Principal Investigator Olivier Jousson
Research Title Engineering of bacterial outer membrane vesicles and of their immunological properties
Research Aims Genetic engineering of OMVs as a potential system for vaccine delivery
Publication Date 4 February 2013
Deadline 25 February 2013 at Midday
Contacts jousson [at] science.unitn.it
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Call n. 14/2013: n. 1 contract of intellectual work service

Responsible for the Activity/Task Alessandro Quattrone
Subject of the Contract

La prestazione, oltre agli obblighi legislativi, deve mirare al miglioramento della qualità di vita degli animali stabulati e consisterà:
- nel controllo, consulenza ed assistenza volte a garantire il buon  mantenimento ed il benessere degli animali utilizzati ai fini sperimentali;
- nel monitoraggio sanitario degli animali stabulati ed in quarantena;
- nel controllare la corretta esecuzione delle procedure sperimentali;
- nella gestione di rapporti con le autorità competenti al fine di garantire il rispetto della legislazione vigente in materia (D. L.vo 116/92) allo scopo di ottemperare alle esigenze amministrative dell’istituzione universitaria;
- nella consulenza e collaborazione con i ricercatori alla stesura dei protocolli sperimentali da inviare agli organi competenti.
Publication Date 18 January 2013
Deadline 04 February 2013 at Midday
Contacts alessandro.quattrone [at] unitn.it
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Call n. 11/2013: n. 1 research fellowship

Principal Investigator Paolo Macchi
Research Title Investigating the roles of the RNA-binding proteins Pumilio 1 and 2 in central nervous system
Research Aims Investigating the role of Pum1 and Pum2 in neuronal stem cell maintenance, axon guidance and cell differentiation using in vitro and in vivo approaches.
Expression analysis of Pum1 and Pum2 proteins in developing brain and migrating neurons.
Expression analysis of Pum1 and Pum2 proteins in neuronal growth cones.
Loss of function approach for Pum1 and Pum2 in vivo.
Identification of potential miRNAs regulating Pum1 and Pum2 translation in the nervous system.
Publication Date 10 January 2013
Deadline 8 February 2013 at Midday
Contacts macchi [at] science.unitn.it
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Call n. 18/2012: n. 1 research fellowship

Principal Investigator Alessandro Quattrone
Research Title Study of the role of the HuR RNA binding protein  in neural tumors and definition of its mechanism of action as a determinat of pathogenesis
Research Aims The activity is aimed at mechanistically dissecting HuR role in the onset and in the development of nervous system tumors, in particular the glioblastoma multiforme
Publication Date 20 December 2012
Deadline 8 January 2013 at Midday
Contacts alessandro.quattrone [at] unitn.it
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Call n. 17/2012: n. 1 research fellowship

Principal Investigator Alessandro Quattrone
Research Title Research and characterization of alterations of translational control in the onset, development or pharmacoresistance of high risk neuroblastoma
Research Aims The activity is aimed at identifying and characterizing by high throughput expression profiles in neuroblastoma cells of alteration of translational control in this type of tumor
Publication Date 20 December 2012
Deadline 8 January 2013 at Midday
Contacts alessandro.quattrone [at] unitn.it
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Call n. 16/2012: n. 1 research fellowship

Principal Investigator Alessandro Quattrone
Research Title Research of candidate drugs modulating translational control in the therapy of high risk neuroblastoma
Research Aims The activity is aimed at designing pharmacological screenings to identify candidate molecules for the therapy of high risk neuroblastoma
Publication Date 20 December 2012
Deadline 8 January 2013 at Midday
Contacts alessandro.quattrone [at] unitn.it
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Call n. 15/2012: n. 1 research fellowship

Principal Investigator Alessandro Quattrone
Research Title Identifying candidate alterations in translational control in neural tumors by computational methods
Research Aims The activity is aimed at investigating the possibility of translational alterations in the onset and development of the neural lineage derived tumors
Publication Date 19 December 2012
Deadline 7 January 2013 at Midday
Contacts alessandro.quattrone [at] unitn.it
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Call n. 14/2012: n. 1 contract of intellectual work service

Responsible for the Activity/Task Alessandro Quattrone
Subject of the Contract

Sviluppo di un sistema gestionale per stabulari
Publication Date 11 December 2012
Deadline 28 December 2012 at Midday
Contacts alessandro.quattrone [at] unitn.it
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Call n. 13/2012: n. 1 contract of intellectual work service

Responsible for the Activity/Task Alessandro Quattrone
Subject of the Contract

Supporto per l’attività a preparazione di proposte progettuali nel contesto di schemi di finanziamento internazionale, in particolare quelli dell’Unione Europea
Publication Date 11 December 2012
Deadline 28 December 2012 at Midday
Contacts alessandro.quattrone [at] unitn.it
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Call n. 12/2012: n. 1 research fellowship

Principal Investigator Olivier Jousson
Research Title Metagenomic community profiling in complex samples with special reference to pathogens
Research Aims

a) Taxonomic and functional characterization of microbial communities based on Next Generation Sequencing and microarray

b) Further characterization of pathogenic microbes by genome sequencing, comparative and functional genomics approaches, with a focus on virulence factors
Publication Date 6 December 2012
Deadline 20 December 2012 at Midday
Contacts jousson [at] science.unitn.it
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Call n. 11/2012: n. 1 research fellowship

Principal Investigator Paolo Macchi
Research Title Investigating  the role of new members of Puf-containing RNA-binding proteins in mammals
Research Aims Genes coding for new members of the Puf-containing RNA-binding protein family have been recently identified in the mammalian genome. The project will focus on studying the biological role(s) of these proteins in mammalian cell lines as well as in neurons.
Publication Date 6 December 2012
Deadline 20 December 2012 at Midday
Contacts macchi [at] science.unitn.it
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Call n. 10/2012: n. 1 research fellowship

Principal Investigator Paolo Macchi
Research Title Investigating the roles of the RNA-binding proteins Pumilio 1 and 2 in central nervous system
Research Aims Investigating the role of Pum1 and Pum2 in neuronal stem cell maintenance, axon guidance and cell differentiation using in vitro and in vivo approaches.
Expression analysis of Pum1 and Pum2 proteins in developing brain and migrating neurons.
Expression analysis of Pum1 and Pum2 proteins in neuronal growth cones.
Loss of function approach for Pum1 and Pum2 in vivo.
Identification of potential miRNAs regulating Pum1 and Pum2 translation in the nervous system.
Publication Date 6 December 2012
Deadline 20 December 2012 at Midday
Contacts macchi [at] science.unitn.it
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Call n. 6/2012: n. 1 study grant for doctoral students who have not been awarded with a doctoral grant enrolled to the International Doctoral School in Biomolecular Sciences

Principal Investigator Sheref S. Mansy
Research Title In vitro fluorescence reporters
Research Aims Constructing in vitro cell like systems that sense the environment and respond to it
Publication Date 4 December 2012
Deadline 19 December 2012 at Midday
Contacts mansy [at] science.unitn.it
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Call n. 7/2012: n. 1 contract of intellectual work service

Responsible for the Activity/Task Marie-Laure Baudet
Subject of the Contract

Investigation of the Role of postranscriptional regulation in developing neurons
Publication Date 04 December 2012
Deadline 19 December 2012 at Midday
Contacts marielaure.baudet [at] unitn.it
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Call n. 1/2012: n. 1 contract of intellectual work service

Responsible for the Activity/Task Olivier Jousson
Subject of the Contract

Implementazione e ulteriore sviluppo di una piattaforma software per la caratterizzazione tassonomica di comunità batteriche da dati di tipo metagenomico
Publication Date 7 November 2012
Deadline 22 November 2012 at Midday
Contacts jousson [at] science.unitn.it
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Call n. 70/2012: n. 1 research fellowship

Principal Investigator Olivier Jousson
Research Title Engineering of bacterial outer membrane vesicles and of their immunological properties
Research Aims Genetic engineering of OMVs as a potential system for vaccine delivery
Publication Date 16 October 2012
Deadline 6 November 2012 at Midday
Contacts jousson [at] science.unitn.it
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Call n. 69/2012: n. 1 contract of intellectual work service

Responsible for the Activity/Task Simona Casarosa
Subject of the Contract

Organizzazione di un servizio di produzione di embrioni di Anfibi e Pesci a differenti stadi di sviluppo, da utilizzare per esperimenti di istologia e biologia molecolare

Cura e mantenimento dei sistemi di stabulazione del CIBIO
Publication Date 15 October 2012
Deadline 5 November 2012 at Midday
Contacts simona.casarosa [at] unitn.it
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Call n. 68/2012: n. 1 research fellowship

Principal Investigator Yuri Bozzi
Research Title Studi di espressione genica in modelli animali di epilessie tardive
Research Aims Identificazione di geni espressi selettivamente in risposta
all’infiammazione in diverse aree di cerebrali di topi epilettici
cronici, al fine di sviluppare nuovi possibili bersagli terapeutici
Publication Date 10 October 2012
Deadline 30 October 2012 at Midday
Contacts yuri.bozzi [at] unitn.it
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Call n. 67/2012: n. 1 research fellowship

Principal Investigator Massimo Pizzato
Research Title Defining molecular mechanisms of retroviral infectivity factors
Research Aims To identify the molecular nature of the activities of Nef (HIV-1)
and glycosylated gag (gammaretroviruses) on retrovirus
infectivity and susceptibility to neutralizing antibodies
Publication Date 10 October 2012
Deadline 12 November 2012 at Midday
Contacts massimo.pizzato [at] unitn.it
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Call n. 59/2012: n. 1 research fellowship

Principal Investigator Francesca Demichelis
Research Title Analisi computazionale di lesioni somatiche associate alla progressione di malattia tumorale da dati ad alta densità
Research Aims Metodi di analisi integrativa di dati high-throughput ortogonali per la caratterizzazione dell’impatto funzionale di mutazioni somatiche in pazienti affetti da tumore utilizzando dati generati da campioni umani e da linee cellulari
Publication Date 23 August 2012
Deadline 12 September 2012 at Midday
Contacts f.demichelis [at] unitn.it
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Call n. 58/2012: n. 1 contract of intellectual work service

Responsible for the Activity/Task Alessandro Quattrone
Subject of the Contract

La prestazione riguarda tre attività.

La prima consiste nella progettazione, attivazione e verifica della funzionalità di una Facility strumentale per lo studio in biosicurezza dei meccanismi molecolari di infettività di HIV e di altri retrovirus presso il CIBIO dell’Università di Trento.

La seconda attività è la messa a punto sempre presso il CIBIO di un metodo per la quantificazione di retrovirus in cellule in coltura.

La terza attività consiste nell’organizzazione di una serie di seminari specialistici per il CIBIO a tema virologia molecolare e nuovi approcci genomici alla virologia.
Publication Date 08 August 2012
Deadline 28 August 2012 at Midday
Contacts alessandro.quattrone [at] unitn.it
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Call n. 57/2012: n. 1 contract of intellectual work service

Responsible for the Activity/Task Alessandro Quattrone
Subject of the Contract Costituzione e avvio dell’attività di Project Management per il Centro per la Biologia Integrata (CIBIO)
Publication Date 31 July 2012
Deadline 20 August 2012 at Midday
Contacts alessandro.quattrone [at] unitn.it
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Call n. 51/2012: n. 1 contract of intellectual work service

Responsible for the Activity/Task Graziano Guella
Subject of the Contract Analisi mediante tecniche LC-MS della variazione del lipidoma totale di cellule, tessuti e microorganismi in seguito a stressori indotti da variazioni ambientali e/o chimici
Publication Date 03 July 2012
Deadline 24 July 2012 at Midday
Contacts graziano.guella [at] unitn.it

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Call n. 48/2012: n. 1 research fellowship

Principal Investigator Simona Casarosa
Research Title Derivazione di induced pluripotent stem cells (iPS) da tessuti umani e murini e loro successivo differenziamento neurale e retinico
Research Aims Generazione di cellule pluripotenti indotte a partire da tessuti adulti umani e murini. Si svilupperanno tecniche di colture cellulari per la loro derivazione e per il successivo differenziamento in cellule neurali e retiniche
Publication Date 03 July 2012
Deadline 24 July 2012 at Midday
Contacts simona.casarosa [at] unitn.it

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Call n. 45/2012: n. 1 research fellowship

Principal Investigator Francesca Demichelis
Research Title Analisi computazionale di lesioni somatiche associate alla progressione di malattia tumorale da dati ad alta densità
Research Aims Metodi di analisi integrativa di dati high-throughput ortogonali per la caratterizzazione dell’impatto funzionale di mutazioni somatiche in pazienti affetti da tumore utilizzando dati generati da campioni umani e da linee cellulari
Publication Date 13 June 2012
Deadline 04 July 2012 at Midday
Contacts f.demichelis [at] unitn.it
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Call n. 43/2012: n. 1 research fellowship

Principal Investigator Yuri Bozzi
Research Title Studi di espressione genica nel cervello di topi mutanti per il gene Engrailed 2 (En2), un modello animale di autismo
Research Aims Utilizzando una vasta serie di tecniche per lo studio dell'espressione genica (microarrays, RT-PCR quantitativa, ibridazione in situ, immunoistochimica), il progetto si propone di:
- identificare geni espressi selettivamente nel cervello dei topi mutanti per il gene En2;
- studiare l’espressione di geni associati all’autismo dei topi mutanti per il gene En2.
Publication Date

11 June 2012
Deadline 02 July 2012 at Midday
Contacts yuri.bozzi [at] unitn.it

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Call n. 39/2012: n. 1 research fellowship

Principal Investigator Sheref S. Mansy
Research Title In vitro selection methods for RNA sensors
Research Aims To develop a new selection protocol for the generation of RNA sensors that control translation in response to molecules of our choosing
Publication Date 22 May 2012
Deadline 12 June 2012 at Midday
Contacts sherefsamir.mansy [at] unitn.it

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Call n. 31/2012: n. 1 research fellowship

Principal Investigator Alessandro Quattrone
Research Title microRNAs in growth cone responsiveness
Research Aims Study of the involvement of post-transcriptional regulation exerted by microRNAs in the shaping of the molecular clock responsible for the developmental establishing of axonal connections to shape neuronal circuitries
Publication Date 03 May 2012
Deadline 24 May 2012 at Midday
Contacts alessandro.quattrone [at] unitn.it
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Call n. 29/2012: n. 1 research fellowship

Principal Investigator Alessandro Quattrone
Research Title Analisi bioinformatiche per la comprensione delle dinamiche del traduttoma
Research Aims L’attività prevede la messa a punto di nuovi strumenti bioinformatica e il loro impiego nella descrizione delle variazioni del tasso di formazione e distruzione di polisomi e del tasso di attività traduzionale corrispondente su scala trascritto mica e su vari modelli cellulari e di patologia. Si farà prevalentemente uso di dati derivati da sequenziamento di nuova generazione
Publication Date 16 April 2012
Deadline 8 May 2012 at Midday
Contacts alessandro.quattrone [at] unitn.it
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Call n. 28/2012: n. 1 research fellowship

Principal Investigator Alessandro Quattrone
Research Title Messa a punto di un metodo di screening basato su cellule atto a identificare composti ad azione post-trascrizionale
Research Aims L’attività prevede la messa a punto di un modello cellulare per l’identificazione di piccole molecole in grado di influenzare negativamente o positivamente l’espressione genica agendo sulle regioni 5’ e 3’ non codificanti dei geni bersaglio. Il saggio verrà applicato come prova a geni coinvolti nel mantenimento dello stato di staminalità in tumori neurali, utilizzando come library farmaci in uso e molecole nutraceutiche
Publication Date 16 April 2012
Deadline 8 May 2012 at Midday
Contacts alessandro.quattrone [at] unitn.it
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Call n. 27/2012: n. 1 research fellowship

Principal Investigator Alessandro Quattrone
Research Title Identificazione di proteine ribosomali fluorescenti utilizzabili per lo studio di poliribosomi mediante tecniche di imaging
Research Aims Il progetto ha come scopo principale quello di identificare alcune proteine ribosomali utilizzabili per lo studio dei poliribosomi in cellula mediante tecniche di imaging. Specificamente verrà clonata una batteria di proteine ribosomali di cui verrà investigata la funzionalità in cellule di mammifero mediante microscopia confocale e microscopia a forza atomica
Publication Date 16 April 2012
Deadline 8 May 2012 at Midday
Contacts alessandro.quattrone [at] unitn.it
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Call n. 25/2012: n. 1 research fellowship

Principal Investigator Sheref S. Mansy
Research Title Modeling in vitro genetic systems
Research Aims To generate predictive models for in vitro, cell-free genetic systems and RNA regulators. More information on our bottom-up synthetic biology research can be found at www.smansy.org
Publication Date 03 April 2012
Deadline 24 April 2012 at Midday
Contacts sherefsamir.mansy [at] unitn.it

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Call n. 24/2012: n. 1 research fellowship

Principal Investigator Alberto Inga
Research Title Functional analysis of disease-associated 5’UTR sequence variants of the CDKN2A gene transcripts
Research Aims Sviluppare ed utilizzare saggi reporter per la caratterizzazione del significato clinico di varianti di sequenza al 5’UTR di CDKN2A/p16INK4A identificate in pazienti con melanoma o tumore pancreatico. Utilizzare la metodica di separazione di RNA citoplasmatico associato a polisomi per valutare l’efficienza di traduzione di RNA messaggeri contenenti le suddette varianti al 5’UTR. Sviluppare saggi reporter ed analisi di espressione genica per caratterizzare il promotore bidirezionale CDKN2ACDKN2BAS. Caratterizzare la capacità di regolazione cap-indipendente della traduzione dei messaggeri CDKN2A/p16INK4A e CDKN2A/p14ARF
Publication Date 28 March 2012
Deadline 17 April 2012 at Midday
Contacts alberto.inga [at] unitn.it
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Call n. 21/2012: n. 1 contract of intellectual work service

Responsible for the Activity/Task Francesca Demichelis
Subject of the Contract Organizzazione, processamento e caratterizzazione molecolare di tessuti istologici tumorali e benigni di pazienti con tumore prostatico trattati con brachiterapia (casistica pregressa).
Supporto all’implementazione di una biobanca
Publication Date 20 March 2012
Deadline 10 April 2012 at Midday
Contacts f.demichelis [at] unitn.it
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Call n. 18/2012 - 26/2012: n. 1 research fellowship

Principal Investigator Francesca Demichelis
Research Title Caratterizzazione dell’impatto funzionale di mutazioni responsabili della progressione di malattia tumorale
Research Aims Metodi di analisi integrativa di dati high-throuput ortogonali per la caratterizzazione dell’impatto funzionale di mutazioni somatiche in pazienti affetti da tumore utilizzando dati generati da campioni umani e da linee cellulari. Metodi analitici per la predizione della variazione della struttura proteica
Publication Date 16 March 2012
Deadline 06 April 2012 at Midday
New Publication Date 16 April 2012
New Deadline 11 June 2012
Contacts f.demichelis [at] unitn.it
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Call n. 16/2012: n. 1 research fellowship

Principal Investigator Anna Cereseto
Research Title Biologia nucleare di HIV-1
Research Aims Analisi ottica e molecolare dell’importo nucleare di HIV-1
Publication Date 09 March 2012
Deadline 30 March 2012 at Midday
Contacts anna.cereseto [at] unitn.it
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Call n. 14/2012: n. 1 contract of intellectual work service

Responsible for the Activity/Task Paolo Macchi
Subject of the Contract Ampliamento dell’offerta didattica e di ricerca della Scuola Internazionale di Dottorato in Scienze Biomolecolari mediante nuove collaborazioni con università e centri di ricerca internazionali
Publication Date 08 March 2012
Deadline 29 March 2012 at Midday
Contacts paolo.macchi [at] unitn.it
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Call n. 11/2012: n. 1 research fellowship

Principal Investigator Alberto Inga
Research Title Regulation of the LIF LAMP3 and PLK3 genes by p53, Estrogen Receptor and NFkB
Research Aims Esaminare la regolazione trascrizionale dei geni in oggetto attraverso saggi in linee cellulari di origine tumorale condotti sui trascritti o proteine endogene od attraverso opportuni saggi reporter. In particolare, dovrà essere valutata nei meccanismi la possibile cooperazione trascrizionale tra il gene soppressore di tumori p53, i recettori per gli estrogeni e p65/relA, appartenente alla famiglia NFkB
Publication Date 01 March 2012
Deadline 22 March 2012 at Midday
Contacts alberto.inga [at] unitn.it
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Call n. 10/2012: n. 1 contract of intellectual work service

Responsible for the Activity/Task Alessandro Quattrone
Subject of the Contract La prestazione riguarda due principali attività:
- corso su temi inerenti alla vaccinologia strutturale e molecolare presso il dottorato internazionale di Biomolecular Sciences dell'Università degli Studi di Trento;
- attività di training e approfondimento culturale di studenti del corso di Laurea in Scienze e Tecnologie Biomolecolari, del dottorato di ricerca e di PostDoc. Tale attività verrà svolta mediante la supervisione scientifica di progetti di ricerca sperimentale presso il CIBIO
Publication Date 22 February 2012
Deadline 14 March 2012 at Midday
Contacts alessandro.quattrone [at] unitn.it
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Call n. 9/2012: n. 1 research fellowship

Principal Investigator Alessandro Quattrone
Research Title Studio di mutazioni con approcci convenzionali e di Next Generation Sequencing su patologie tumorali e loro correlazione col fenotipo di malattia e con la risposta ai farmaci
Research Aims L’attività prevede l’identificazione di mutazioni con metodo tradizionale Sanger e la messa a punto di metodi alternativi basati su Next Generation Sequencing su campioni tumorali e su soggetti affetti da neoplasie allo scopo di stabilire correlazioni con la prognosi della malattia e con la risposta al trattamento chemioterapico e radioterapico
Publication Date 10 February 2012
Deadline 2 March 2012 at Midday
Contacts alessandro.quattrone [at] unitn.it
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Call n. 8/2012: n. 1 research fellowship

Principal Investigator Alessandro Quattrone
Research Title Progettazione e sviluppo di un’attività di ricerca in Biologia Sintetica tramite ingegnerizzazione genetica di microorganismi
Research Aims Produzione di batteri ingegnerizzati tramite biobricks con potenziale applicativo nelle biotecnologie industriali o biomediche
Publication Date 10 February 2012
Deadline 2 March 2012 at Midday
Contacts alessandro.quattrone [at] unitn.it
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Call n. 7/2012: n. 1 research fellowship

Principal Investigator Alberto Inga
Research Title Functional crosstalk between p53 and NFkB transcription factors
Research Aims Esaminare i meccanismi e i geni bersaglio della cooperazione trascrizionale tra il fattore di trascrizione p53 e p56/relA, appartenente alla famiglia NFkB
Publication Date 07 February 2012
Deadline 27 February 2012 at Midday
Contacts alberto.inga [at] unitn.it
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Call n. 6/2012: n. 1 research fellowship

Principal Investigator Alessandro Provenzani
Research Title Ruolo della proteina HuR nell’insorgenza della resistenza alla doxorubicina nel tumore al seno
Research Aims Il progetto ha come scopo principale quello di identificare specifici geni che possono essere correlati con l'insorgenza della farmaco resistenza alla doxorubicina. Specificamente verrà investigato il ruolo della proteina HuR nel regolare il livello di espressione genica delle proteine implicate nella risposta cellulare alla doxorubicina in modelli cellulari resistenti al farmaco
Publication Date 02 February 2012
Deadline 22 February 2012 at Midday
Contacts alessandro.provenzani [at] unitn.it
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Call n. 3/2012: n. 1 research fellowship

Principal Investigator Michela A. Denti
Research Title Uso di RNA antisenso per la correzione dello splicing come possibile terapia della demenza frontotemporale
Research Aims Valutazione dell’efficacia in cellule in coltura ed in vivo, di RNA antisenso come modulatori dello splicing del pre-mRNA di tau, per l’individuazione di una possibile strategia terapeutica per la Demenza Frontotemporale con Parkinsonismo legata al cromosoma 17 (FTDP-17)
Publication Date 23 January 2012
Deadline 13 February 2012 at Midday
Contacts michela.denti [at] unitn.it
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